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Manipulation des micro-organismes en enseignement : un nouveau cadre réglementaire

Une nouvelle circulaire publiée au Bulletin officiel n° 35 du 17 septembre 2026 précise les interdictions et les conditions de manipulation des produits biologiques et des micro-organismes lors des activités pratiques et technologiques. Elle concerne notamment les formations de la série STL ainsi que les BTS relevant de la biologie appliquée.

Cette circulaire du 19 août 2026 abroge et remplace la circulaire du 8 août 1973 qui encadrait jusqu’à présent la manipulation des souches microbiennes dans les lycées techniques. Elle actualise ainsi le cadre réglementaire en tenant compte des règles actuelles relatives aux agents biologiques, aux niveaux de confinement et aux organismes génétiquement modifiés.

Ce qu’il faut retenir

Le texte rappelle plusieurs principes essentiels pour l’organisation des activités expérimentales :

  • l’utilisation des micro-organismes doit être progressive et cohérente avec le niveau de formation des élèves et étudiants ;
  • en première et terminale STL, les activités de microbiologie sont réalisées à partir de souches pures de collection dont les caractéristiques sont connues ;
  • la manipulation d’agents biologiques du groupe 2 n’est possible que lorsque les objectifs pédagogiques le justifient, avec des élèves suffisamment formés et dans des salles techniques répondant au niveau de confinement 2 ;
  • une évaluation des risques doit être conduite avec les élèves avant les manipulations concernées et les conduites à tenir en cas de déversement, d’exposition ou de dissémination accidentelle doivent être établies et connues ;
  • la manipulation de produits d’origine humaine, animale ou environnementale est réservée aux sections de techniciens supérieurs ayant reçu une formation suffisante. En l’absence de certitude sur les agents biologiques présents, ces échantillons doivent être considérés comme susceptibles de contenir au minimum des agents du groupe 2 et manipulés en confinement 2.

Une liste actualisée des micro-organismes utilisables

L’annexe II de la circulaire propose une liste des souches de micro-organismes dont les démonstrations et manipulations sont autorisées dans les établissements d’enseignement, en précisant leur niveau de confinement.

L’utilisation d’une souche ne figurant pas dans cette liste reste possible dans certaines situations, notamment pour les projets technologiques ou la formation des étudiants de BTS, après consultation des IA-IPR référents de biotechnologie-génie biologique et réalisation d’une analyse des risques adaptée.

Cette nouvelle circulaire constitue donc un document de référence pour les enseignants et personnels de laboratoire et invite les équipes à vérifier l’adéquation de leurs pratiques, des souches utilisées et de l’organisation de leurs salles techniques avec ce nouveau cadre.

👉 Consulter la circulaire et ses annexes :
Bulletin officiel n° 35 du 17 septembre 2026 – Interdictions et conditions de manipulation de micro-organismes