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TD de Biologie moléculaire : recherche d’une mutation responsable de la drépanocytose

Cette activité est une activité Moodle de type ‘leçon‘.
Elle permet de comprendre comment détecter une mutation responsable de la drépanocytose sur le gène de l’hémoglobine en utilisant la PCR, les enzymes de restriction et l’électrophorèse sur gel d’agarose
.

Pour avoir une idée plus précise du contenu avant installation, vous pouvez télécharger le corrigé (pdf).

L’activité est téléchargeable via le lien suivant :
leçon Moodle à installer
correction (pdf)
Pour installer cette leçon, télécharger le fichier ci-dessus. Le “restaurer” dans une leçon Moodle comme expliqué dans ce tutoriel.
Une fois le leçon restaurée dans un cours, vous pouvez la modifier, par exemple en y ajoutant des questions de type quiz (utilisateurs avancés).

Dans cette « leçon » Moodle, les différents outils utilisés sont :

  • « Nucleotide blast » pour comparer les séquences étudiées à une base de données,
  • « Nucleotide blast » pour aligner 2 séquences et calculer le pourcentage d’identité entre 2 séquences,
  • « translate» d’ExPASy pour réaliser la traduction de séquences nucléotidiques (ou des outils de « Bioinformatics made simple »),
  • « primer-blast » pour trouver des amorces de PCR,
  • « SMS Primer map » pour vérifier les amorces choisies,
  • « NebCutter» pour rechercher des sites de restriction sur une séquence d’ADN et visualiser les conséquences des coupures sur des simulations de gels d’agarose.