{"id":719,"date":"2016-02-17T22:22:25","date_gmt":"2016-02-17T21:22:25","guid":{"rendered":"http:\/\/ent2d.ac-bordeaux.fr\/disciplines\/svt\/?page_id=719"},"modified":"2016-11-30T19:57:14","modified_gmt":"2016-11-30T18:57:14","slug":"logiciel-rastop","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/ent2d.ac-bordeaux.fr\/disciplines\/svt\/logiciel-rastop\/","title":{"rendered":"Logiciel Rastop"},"content":{"rendered":"

\"imageS2N\"<\/a><\/p>\n\n\n\n\n\n\n\n
Principales fonctions<\/b><\/td>\nProc\u00e9dures<\/b><\/td>\n<\/tr>\n
\u00a0VISUALISER UNE MOLECULE<\/b><\/td>\n1-1 : Charger la mol\u00e9cule<\/b> : dans le menu choisir \u00ab\u00a0fichier<\/b>\u00a0\u00bb cliquer sur\u00a0 \u00ab\u00a0ouvrir<\/b>\u00a0\u00bb , s\u00e9lectionner la mol\u00e9cule dans la fen\u00eatre qui s’ouvre ou bien rechercher le dossier ad\u00e9quat en suivant le chemin indiqu\u00e9 par le professeur.
\n1-2<\/b> : S\u00e9l<\/b><\/b>ectionner un mode de repr\u00e9sentation<\/b> : menu \u00ab\u00a0Rubans<\/b>\u00a0\u00bb puis \u00ab\u00a0afficher seul<\/b>\u00a0\u00bb ou parmi les ic\u00f4nes repr\u00e9sentation en sph\u00e8res\"\" , en b\u00e2tonnets\u00a0\"\" etc.<\/p>\n

Remarque<\/b> : Il est possible de d\u00e9placer la mol\u00e9cule en maintenant le bouton droit de la souris enfonc\u00e9. Le gliss\u00e9 gauche permet de la faire tourner dans l’espace autour des axes X et Y. La touche MAJ + bouton droit permet de la faire tourner autour de l’axe Z. Il est possible de zoomer en appuyant sur Maj et en faisant glisser avec le bouton gauche enfonc\u00e9.<\/td>\n<\/tr>\n

REPERER LA STRUCTURE D’UNE MOLECULE<\/b> <\/td>\n2-1<\/b> : Rep\u00e9rer le nombre de cha\u00eenes <\/b>:\u00a0 dans le menu \u00ab\u00a0atomes<\/b>\u00a0\u00bb choisir \u00ab\u00a0colorer par cha\u00eene<\/b>\u00a0\u00bb
\n2-2<\/b> : Rep\u00e9rer le nombre d’acides amin\u00e9s ou de nucl\u00e9otides <\/b>: dans le menu choisir \u00ab\u00a0mol\u00e9cule<\/b>\u00a0\u00bb puis \u00ab\u00a0s\u00e9quence<\/b>\u00a0\u00bb . Le nom des acides amin\u00e9s ou des nucl\u00e9otides appara\u00eet avec leur position
\n2-3<\/b> : Afficher les liaisons entre diff\u00e9rentes parties de la mol\u00e9cule<\/b> :
\n– Visualiser les liaisons hydrog\u00e8ne<\/b> : dans le menu choisir : \u00ab\u00a0liaisons<\/b>\u00a0\u00bb ,\u00a0\u00bbliaisons hydrog\u00e8nes<\/b>\u00a0\u00bb , \u00ab\u00a0type<\/b>\u00ab\u00a0, \u00ab\u00a0b\u00e2tonnets<\/b>\u00ab\u00a0, choisir une \u00e9paisseur du trait ; colorer en utilisant la palette de couleurs\u00a0\"\"<\/b>et choisissant \u00ab\u00a0liaisons hydrog\u00e8nes<\/b>\u00ab\u00a0.<\/p>\n

Pour effacer les liaisons hydrog\u00e8ne. dans le menu choisir : \u00ab\u00a0liaisons<\/b>\u00a0\u00bb , \u00ab\u00a0liaisons hydrog\u00e8nes<\/b>\u00a0\u00bb \u00ab\u00a0effacer<\/b>\u00ab\u00a0<\/i>– Visualiser les liaisons disulfure<\/b> : dans le menu choisir : \u00ab\u00a0liaisons<\/b>\u00a0\u00bb , \u00ab\u00a0ponts disulfures<\/b>\u00ab\u00a0, \u00ab\u00a0type<\/b>\u00a0\u00bb , \u00ab\u00a0b\u00e2tonnets<\/b>\u00a0\u00bb puis une \u00e9paisseur du trait ; colorer en utilisant la palette de couleurs <\/b>et en choisissant \u00ab\u00a0ponts disulfures<\/b>\u00ab\u00a0<\/td>\n<\/tr>\n

IDENTIFIER UNE PARTIE DE LA MOLECULE<\/b><\/td>\n3-1<\/b> :\u00a0\u00a0 Identifier une cha\u00eene <\/b>: cliquer sur la cha\u00eene, le nom appara\u00eet sur la fen\u00eatre du bas
\n3-2<\/b> : Identifier des acides amin\u00e9s ou des nucl\u00e9otides<\/b> : Cliquer sur\u00a0\"\"\u00a0 pour activer le mode s\u00e9lection. Avec le pointeur, cliquer sur l’\u00e9cran et tirer pour d\u00e9crire un quadrilat\u00e8re englobant une portion de la mol\u00e9cule.
\nDans le menu choisir \u00ab\u00a0Editer<\/b>\u00a0\u00bb puis \u00ab\u00a0restreindre<\/b>\u00a0\u00bb et lire dans le panneau de commande le nombre d’atomes s\u00e9lectionn\u00e9s.\u00a0 Identifier les acides amin\u00e9s ou les nucl\u00e9otides correspondants<\/td>\n<\/tr>\n
SELECTIONNER UNE PARTIE DE LA MOLECULE<\/b><\/td>\n4-1<\/b> : S\u00e9l<\/b><\/b>ectionner des acides amin\u00e9s ou des nucl\u00e9otides particuliers<\/b> : Dans la barre d’outils cliquer sur le cadre de commande (cadre Abc\"\"<\/b> ) ou dans le menu \u00ab\u00a0\u00e9diter<\/b>\u00a0\u00bb puis\u00a0 \u00ab\u00a0commande<\/b>\u00a0\u00bb
\nTaper les num\u00e9ros des acides amin\u00e9s ou des nucl\u00e9otides : 1,2,3\u2026
\nDans le menu choisir \u00ab\u00a0edition<\/b>\u00a0\u00bb puis \u00ab\u00a0restreindre<\/b>\u00a0\u00bb
\nAfficher en b\u00e2tonnets\u00a0\"\" et colorer les diff\u00e9rents acides amin\u00e9s ou nucl\u00e9otides : dans la barre d’outils cliquer sur le cadre de commande (cadre Abc\"\"<\/b>\u00a0 ) puis taper le num\u00e9ro de chaque acide amin\u00e9 et le colorer ou bien choisir l’ic\u00f4ne \u00e0 droite\u00a0\u00a0\u00a0 et choisir une couleur. Le nom du groupe s\u00e9lectionn\u00e9 s’affiche sur le tableau de dialogue.4-2<\/b> : S\u00e9l<\/b>ectionner une cha\u00eene<\/b> (substrat, antig\u00e8ne \u2026) choisir\u00a0\u00a0 taper *nom de la cha\u00eene.<\/b> Afficher en b\u00e2tonnets\u00a0\"\"<\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Principales fonctions Proc\u00e9dures \u00a0VISUALISER UNE MOLECULE 1-1 : Charger la mol\u00e9cule : dans le menu choisir \u00ab\u00a0fichier\u00a0\u00bb cliquer sur\u00a0 \u00ab\u00a0ouvrir\u00a0\u00bb , s\u00e9lectionner la mol\u00e9cule dans la fen\u00eatre qui s’ouvre ou bien rechercher le dossier ad\u00e9quat en suivant le chemin indiqu\u00e9 par le professeur. 1-2 : S\u00e9lectionner un mode de repr\u00e9sentation : menu \u00ab\u00a0Rubans\u00a0\u00bb puis \u00ab\u00a0afficher … <\/p>\n

Lire la suite<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":8,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"template-twocolumnsright.php","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-719","page","type-page","status-publish","hentry","nodate","item-wrap"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ent2d.ac-bordeaux.fr\/disciplines\/svt\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/719","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ent2d.ac-bordeaux.fr\/disciplines\/svt\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/ent2d.ac-bordeaux.fr\/disciplines\/svt\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ent2d.ac-bordeaux.fr\/disciplines\/svt\/wp-json\/wp\/v2\/users\/8"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ent2d.ac-bordeaux.fr\/disciplines\/svt\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=719"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/ent2d.ac-bordeaux.fr\/disciplines\/svt\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/719\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":723,"href":"https:\/\/ent2d.ac-bordeaux.fr\/disciplines\/svt\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/719\/revisions\/723"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ent2d.ac-bordeaux.fr\/disciplines\/svt\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=719"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}